墨尔本大学提供400多个研究生课程，包括以下学院和系。
- 建筑、建筑与规划学院
- 墨尔本设计学院
- 文学院
- 人文社会科学研究生院
- 商业和经济学院
- 墨尔本商学院
- 墨尔本专业与继续教育学院
- 墨尔本教育研究生院
- 墨尔本工程学院
- 计算机与信息系统学院
- 艺术和音乐学院
- 维多利亚艺术学院
- 墨尔本音乐学院
- 墨尔本法学院
- 墨尔本政府学院
- 医学、牙科和健康科学学院。
- 墨尔本牙科学校
- 墨尔本医学院
- 墨尔本健康科学学院
- 墨尔本人口与全球健康学院
- 墨尔本心理科学学院
- 生物医学科学学院
- 理学院
- 生物科学学院
- 化学学院
- 地球科学学院
- 生态系统和森林科学学院
- 地理学院
- 数学与统计学院
- 物理学院
- 兽医和农业科学学院